Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga6Q61739 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms