Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Fscn1Q61553 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Fscn1Q61553 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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Fscn1Q61553 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Fscn1Q61553 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Fscn1Q61553 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Fscn1Q61553 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms