Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1aQ61495 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms