Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde3bQ61409 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pde3bQ61409 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde3bQ61409 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms