Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf12Q61286 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf12Q61286 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf12Q61286 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf12Q61286 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf12Q61286 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf12Q61286 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms