Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxd3Q61060 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms