Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp4Q60972 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms