Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tbc1d1Q60949 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Tbc1d1Q60949 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Tbc1d1Q60949 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Tbc1d1Q60949 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d1Q60949 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tbc1d1Q60949 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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