Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik1Q60934 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik1Q60934 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms