Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HellsQ60848 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HellsQ60848 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HellsQ60848 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HellsQ60848 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HellsQ60848 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HellsQ60848 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HellsQ60848 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HellsQ60848 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HellsQ60848 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HellsQ60848 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HellsQ60848 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HellsQ60848 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HellsQ60848 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms