Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot7Q60809 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot7Q60809 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms