Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klf4Q60793 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms