Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn11Q60771 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn11Q60771 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn11Q60771 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn11Q60771 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn11Q60771 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn11Q60771 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn11Q60771 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn11Q60771 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn11Q60771 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms