Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms