Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Samhd1Q60710 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms