Protein–RNA interactions for Protein: Q60687

Fshb, Follitropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FshbQ60687 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FshbQ60687 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FshbQ60687 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms