Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sin3aQ60520 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms