Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms