Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdcp1Q5U462 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms