Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1Q5SXY1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms