Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d9bQ5SVR0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d9bQ5SVR0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d9bQ5SVR0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d9bQ5SVR0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d9bQ5SVR0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tbc1d9bQ5SVR0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms