Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctc1Q5SUQ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms