Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms