Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps54Q5SPW0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms