Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg7Q5RJH6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg7Q5RJH6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms