Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlha9Q5RJB0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms