Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms