Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms