Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nsrp1Q5NCR9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsrp1Q5NCR9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms