Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf2Q5NC05 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms