Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoblQ5NBX1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms