Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps41Q5KU39 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps41Q5KU39 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps41Q5KU39 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms