Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3kQ5GIG6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3kQ5GIG6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms