Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5EBG8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5EBG8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms