Protein–RNA interactions for Protein: Q501J2

Fam173a, Protein FAM173A, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173aQ501J2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam173aQ501J2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fam173aQ501J2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Fam173aQ501J2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam173aQ501J2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms