Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snhg11Q4G0K9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snhg11Q4G0K9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snhg11Q4G0K9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snhg11Q4G0K9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snhg11Q4G0K9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snhg11Q4G0K9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms