Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Syne3Q4FZC9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syne3Q4FZC9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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