Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Shank3Q4ACU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms