Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms