Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6430531B16RikQ3V2J1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
6430531B16RikQ3V2J1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms