Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-4Q3V2D6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-4Q3V2D6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap1-4Q3V2D6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms