Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc110Q3V125 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms