Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc185Q3V118 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms