Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp48Q3V0C5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 958.6 ms