Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3UZV7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UZV7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UZV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms