Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9Q3UYK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d9Q3UYK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9Q3UYK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9Q3UYK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9Q3UYK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9Q3UYK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9Q3UYK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9Q3UYK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d9Q3UYK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.5 ms