Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc160Q3UYG1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms