Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms