Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E330034G19RikQ3UWX6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms