Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn13Q3UW68 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn13Q3UW68 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms